Уродженець Мозамбіка, зробив собі ім'я у складі «Бенфіки» та збірної Португалії, якій допоміг пробитися в півфінал чемпіонату світу 1966 року. У 64 матчах за збірну Португалії він забив 41 гол. На чемпіонаті світу 1966 року в Англії він став кращим бомбардиром, записавши на свій рахунок дев'ять м'ячів. У 1965-му Ейсебіо був визнаний кращим футболістом року в Європі, а в 1968-му і 1973-му вигравав «Золоту бутсу».
У період з 1960 по 1975 рік він захищав кольори «Бенфіки». У складі «орлів» Ейсебіо 11 разів ставав чемпіоном Португалії і ще п'ять разів завойовував кубок країни. Всього в 715 матчах за «Бенфіку» він провів 727 м'ячів. Ейсебіо домігся величезного визнання в тому числі і завдяки успішним виступам у єврокубках. Зокрема, він привів «Бенфіку» до пам'ятного тріумфу в Кубку європейських чемпіонів, який є попередником сучасної Ліги чемпіонів. У фіналі розіграшу-1961/62 португальцям протистояв «Реал», однак завдяки зусиллям Ейсебіо, якийо формив дубль, «Бенфіка» виявилася сильнішою - 5:3.